科學研究
社會科學科研機構
| 國家級科研機構 | 教育部人文社會科學重點研究基地中國農村教育發展研究院 教育部人文社會科學重點研究基地世界文明史研究中心 教育部高校輔導員培訓和研修基地（東北師大） 教育部國別與區域研究中心東亞研究院 |
| 吉林省人文社科重點研究基地 | 思想政治教育研究中心 東亞研究院 思想政治理論課教學方法改革研究中心 中國基礎外語教育研究中心 中國地方政府治理現代化研究中心 中國學校美育研究中心 傳統文化與當代中國哲學研究中心 世界文學與比較文學研究中心 城鎮化與區域發展研究中心 學校藝術教育質量監測研究基地 吉劇藝術與文化研究基地 中國共產黨思想政治教育文獻研究中心 心理健康教育研究中心 東北抗聯與偽滿洲國資料研究中心 英語語言史研究中心 西方馬克思主義現代性理論研究中心 |
| 吉林省重大需求協同創新中心 | 教師教育東北協同創新中心 中國農村教育發展重大需求協同創新中心 創新創業教育重大需求協同創新中心 教育信息化重大需求協同創新中心 文化創意產業協同創新中心（培育） 長白山音樂舞蹈藝術協同創新中心（培育） |
| 吉林省特色新型高校智庫 | 思想政治教育研究中心 東亞文明研究中心 中國地方政府治理現代化研究中心 社會主義核心價值觀教育研究中心（培育） 中國體育公共外交研究中心（培育） |
| 其它省級智庫 | 黨內法規建設研究基地 |
| 吉林省社會科學重點研究領域基地 | “偽滿”歷史文化研究基地 |
| 吉林省高等教育研究基地 | 吉林省現代大學治理研究基地 |
| 校、院共管科研機構 | 區域國別研究院 |
自然科學研究機構
| 國家工程實驗室 | 藥物基因和蛋白篩選國家工程實驗室 |
| 國家野外科學觀測研究站 | 吉林松嫩草地生態系統國家野外科學觀測研究站 |
| 生態環境部重點實驗室 | 國家環境保護濕地生態與植被恢復重點實驗室 |
| 國家地方聯合工程實驗室 | 動力電池國家地方聯合工程實驗室 |
| 國家草品種區域試驗站 | 國家草品種區域試驗站（長嶺） |
| 國家應用數學中心 | 吉林國家應用數學中心 |
| 國家藥監局重點實驗室 | 細胞和基因藥物質量控制重點實驗室 |
| 教育部重點實驗室 | 植被生態科學教育部重點實驗室 |
| 教育部工程研究中心 | 農業與醫藥基因工程研究中心 |
| 教育部野外科學觀測研究站 | 松嫩草地生態系統教育部野外科學觀測研究站 |
| 吉林省重點實驗室 | 吉林省生態恢復與生態系統管理重點實驗室 |
| 吉林省科技創新中心 | 吉林省鋰離子電池材料科技創新中心 |
| 吉林省應用數學中心 | 吉林省應用數學與交叉科學中心 |
| 吉林省國際合作基地 | 人類干細胞庫國際（科技合作基地）聯合研究中心 |
| 吉林省工程實驗室 | 吉林省腦認知與類腦智能工程實驗室 |
| 吉林省工程研究中心 | 吉林省教育與人工智能融合創新工程研究中心 |
| 吉林省高等學校重點實驗室 | 中國東北資源環境研究吉林省高等學校重點實驗室 教育軟件吉林省高等學校重點實驗室 智能信息處理吉林省高等學校重點實驗室 認知與腦科學吉林省高等學校重點實驗室 納米生物傳感分析吉林省高等學校重點實驗室 |
| 吉林省協同創新中心 | 固態電池吉林省協同創新中心 |
| 吉林省高端科技創新平臺 | 先進能源材料研究中心 |
| 其他省級科研機構 | 吉林省中藥生物工程重點研究室 吉林省現代生物醫藥專業技術服務中心 長春市網絡教育關鍵支撐技術科技創新中心 |
| 校內科研機構 | 應用數學研究所 大應用數學實驗室 生物數學中心 統計信息咨詢中心 |
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